11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1960 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  868    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1963  hypothetical protein  50.11 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0643426  normal  0.380201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  68.75 
 
 		 269 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  70.72 
 
 		 573 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  35.04 
 
 		 703 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  30.38 
 
 		 773 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  28.02 
 
 		 772 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  33.55 
 
 		 282 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  26.15 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  28.9 
 
 		 1107 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  29.1 
 
 		 296 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>