39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3452 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  57.53 
 
 		 296 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  42.59 
 
 		 395 aa  185  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  44.16 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  38.46 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  32.84 
 
 		 956 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  32.64 
 
 		 783 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.93 
 
 		 1426 aa  85.9  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  32.52 
 
 		 604 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  31.18 
 
 		 599 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  34.81 
 
 		 1107 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  35.88 
 
 		 772 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  49.46 
 
 		 787 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 743 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  31.78 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.76 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  30.3 
 
 		 773 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  33.16 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  27 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  35.46 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1538 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 480 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  37.07 
 
 		 554 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  31.98 
 
 		 508 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  29.87 
 
 		 757 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  32.87 
 
 		 573 aa  48.9  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  29 
 
 		 589 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  26.09 
 
 		 504 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  29.41 
 
 		 720 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  29.41 
 
 		 720 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  32.56 
 
 		 545 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  30.43 
 
 		 596 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1081  hypothetical protein  34.38 
 
 		 521 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.5 
 
 		 3427 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  37.5 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1421  hypothetical protein  40.79 
 
 		 575 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000284545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  28.24 
 
 		 724 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>