19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0072 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  100 
 
 		 480 aa  993    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  36.23 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  36.92 
 
 		 380 aa  257  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1123 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  30.45 
 
 		 571 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  33.33 
 
 		 591 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  27.4 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  29.61 
 
 		 746 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  29.67 
 
 		 709 aa  53.9  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  30.15 
 
 		 230 aa  53.9  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  30.77 
 
 		 317 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1152 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  34.52 
 
 		 588 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  32.11 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  31.07 
 
 		 724 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  28.97 
 
 		 720 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  28.97 
 
 		 720 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  35.14 
 
 		 282 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>