50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03098 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  100 
 
 		 591 aa  1180    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  49.13 
 
 		 571 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  46.44 
 
 		 1123 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  35.32 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  37.56 
 
 		 317 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.13 
 
 		 1107 aa  99.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  34.41 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  35.98 
 
 		 380 aa  93.6  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  32.39 
 
 		 746 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  36.72 
 
 		 1152 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  30.17 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.29 
 
 		 1217 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  29.85 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  32.43 
 
 		 855 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.39 
 
 		 869 aa  64.3  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  34.46 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.91 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 1750 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.3 
 
 		 1771 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.36 
 
 		 1011 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  35.06 
 
 		 1393 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.73 
 
 		 868 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  28.14 
 
 		 765 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  32.12 
 
 		 868 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 868 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 		 868 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.85 
 
 		 1212 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  30.49 
 
 		 867 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  31.45 
 
 		 816 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  32.73 
 
 		 623 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  28.44 
 
 		 868 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.9 
 
 		 868 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  32.32 
 
 		 1393 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1022 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  31.4 
 
 		 645 aa  47  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35.56 
 
 		 3197 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1011 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  32.19 
 
 		 1300 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  28.89 
 
 		 1258 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.88 
 
 		 3278 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  27.39 
 
 		 179 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  34.62 
 
 		 3197 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  31.87 
 
 		 820 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  29.03 
 
 		 528 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  32.71 
 
 		 994 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  31.29 
 
 		 985 aa  43.9  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  30.95 
 
 		 901 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.23 
 
 		 972 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  31.15 
 
 		 245 aa  43.5  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>