213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004053 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  100 
 
 		 994 aa  2044    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  28.95 
 
 		 998 aa  155  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.61 
 
 		 811 aa  127  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  28.09 
 
 		 513 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  30.03 
 
 		 566 aa  110  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  31.38 
 
 		 1367 aa  98.2  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.21 
 
 		 2153 aa  96.3  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0132  hypothetical protein  25.5 
 
 		 881 aa  94  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  37.2 
 
 		 855 aa  91.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.9 
 
 		 850 aa  92  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.51 
 
 		 994 aa  91.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  29 
 
 		 1363 aa  90.1  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  32.38 
 
 		 1024 aa  89.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.2 
 
 		 1597 aa  86.3  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  46.94 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  37.57 
 
 		 972 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.64 
 
 		 892 aa  82  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  28.06 
 
 		 1215 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.81 
 
 		 1215 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.62 
 
 		 761 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  28.46 
 
 		 721 aa  77.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.5 
 
 		 2503 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  33.99 
 
 		 848 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.5 
 
 		 3699 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.35 
 
 		 3191 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.45 
 
 		 2522 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.45 
 
 		 3544 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  33.5 
 
 		 3699 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  31.28 
 
 		 985 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  29.96 
 
 		 1393 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  31 
 
 		 1393 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  22.96 
 
 		 733 aa  71.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.21 
 
 		 3816 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  32.62 
 
 		 3474 aa  71.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  29.57 
 
 		 3477 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  25.38 
 
 		 778 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  30.56 
 
 		 1028 aa  68.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  30.56 
 
 		 1096 aa  68.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.03 
 
 		 1292 aa  67.4  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  30.7 
 
 		 833 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  27.14 
 
 		 1269 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  26.84 
 
 		 1215 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.84 
 
 		 1215 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.52 
 
 		 4978 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  30.99 
 
 		 656 aa  66.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  29.03 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  30.43 
 
 		 3278 aa  66.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1825 aa  65.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.89 
 
 		 1283 aa  65.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  32.46 
 
 		 2476 aa  65.1  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2456  secreted metalloprotease  23.59 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.055863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  46.74 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  37.23 
 
 		 746 aa  63.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  32.99 
 
 		 848 aa  63.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  42.17 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.03 
 
 		 1286 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  36.76 
 
 		 868 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  26.45 
 
 		 1215 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.67 
 
 		 1212 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  26.53 
 
 		 1035 aa  62  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  36.76 
 
 		 868 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  37.96 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  27.76 
 
 		 1268 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  25.61 
 
 		 2027 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  38.98 
 
 		 1502 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  38.55 
 
 		 1258 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  24.15 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1011 aa  58.9  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.8 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  38.79 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  29.47 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  33.33 
 
 		 938 aa  58.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  29.24 
 
 		 1107 aa  58.2  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  38 
 
 		 556 aa  57.4  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.93 
 
 		 11716 aa  57.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.32 
 
 		 1269 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 868 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  33.99 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1208 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  38.04 
 
 		 1911 aa  57  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.03 
 
 		 744 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.93 
 
 		 1750 aa  56.6  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.59 
 
 		 867 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.22 
 
 		 2816 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 868 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  39.13 
 
 		 3089 aa  56.2  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  30.26 
 
 		 570 aa  56.2  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 		 1217 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  39.51 
 
 		 950 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  32.59 
 
 		 868 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  36.54 
 
 		 516 aa  55.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.74 
 
 		 3927 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.45 
 
 		 747 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.81 
 
 		 2114 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.44 
 
 		 1771 aa  55.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.3 
 
 		 1011 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  33.81 
 
 		 938 aa  55.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  30.39 
 
 		 450 aa  54.7  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.67 
 
 		 913 aa  54.7  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>