120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0484 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  37.79 
 
 
2047 aa  792    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  39.86 
 
 
2051 aa  1120    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  38.87 
 
 
2011 aa  1114    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  52.19 
 
 
2039 aa  1686    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  34.53 
 
 
2052 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  33.28 
 
 
2043 aa  681    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  37.98 
 
 
2084 aa  962    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
2027 aa  3977    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  40.48 
 
 
2056 aa  1176    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  39.78 
 
 
2040 aa  1157    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  40.62 
 
 
2067 aa  1098    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  32.25 
 
 
2069 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  30.62 
 
 
1994 aa  499  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  35.46 
 
 
1001 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  28.6 
 
 
1052 aa  220  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.53 
 
 
5745 aa  162  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  29.14 
 
 
721 aa  135  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.27 
 
 
3191 aa  134  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.33 
 
 
1367 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.09 
 
 
4848 aa  126  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  27.43 
 
 
1363 aa  119  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  30.24 
 
 
1269 aa  119  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.14 
 
 
9867 aa  119  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.57 
 
 
1597 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.32 
 
 
4122 aa  115  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.02 
 
 
1268 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.35 
 
 
4978 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  29.06 
 
 
1269 aa  100  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.04 
 
 
2816 aa  98.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  29.89 
 
 
9585 aa  97.1  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.62 
 
 
3477 aa  89.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.54 
 
 
1215 aa  87.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.06 
 
 
1884 aa  87.4  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.54 
 
 
1215 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 
1215 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 
1215 aa  83.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28.92 
 
 
1215 aa  83.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 
3816 aa  82  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  27.79 
 
 
2042 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.94 
 
 
2114 aa  75.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  31.18 
 
 
744 aa  74.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  25.24 
 
 
3474 aa  73.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  31.13 
 
 
864 aa  72.8  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  29.84 
 
 
1879 aa  72  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.88 
 
 
2192 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  27.49 
 
 
2153 aa  68.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  27.54 
 
 
814 aa  65.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.84 
 
 
2476 aa  64.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.37 
 
 
3699 aa  64.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  34.03 
 
 
3911 aa  63.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.52 
 
 
2555 aa  63.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 
3363 aa  63.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  26.57 
 
 
892 aa  62  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.37 
 
 
3699 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  25.76 
 
 
1744 aa  60.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  28.91 
 
 
663 aa  61.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.88 
 
 
2503 aa  60.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  27.68 
 
 
2715 aa  60.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.62 
 
 
725 aa  59.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  29.19 
 
 
1911 aa  59.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  24.83 
 
 
2839 aa  59.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.52 
 
 
3544 aa  59.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.73 
 
 
994 aa  58.9  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.19 
 
 
3089 aa  58.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  24.58 
 
 
1628 aa  58.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.88 
 
 
2522 aa  57.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  27.35 
 
 
2767 aa  57.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.5 
 
 
1066 aa  57.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  28.32 
 
 
448 aa  56.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  29.78 
 
 
865 aa  57  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  23.95 
 
 
16322 aa  57  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.28 
 
 
480 aa  57  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  28 
 
 
3333 aa  56.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  41 
 
 
1752 aa  56.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  36 
 
 
516 aa  55.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.72 
 
 
1502 aa  55.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  38.4 
 
 
2401 aa  54.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  38.4 
 
 
2437 aa  54.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  29.59 
 
 
994 aa  54.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.47 
 
 
8321 aa  53.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  26.42 
 
 
680 aa  53.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.75 
 
 
2170 aa  53.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  38.33 
 
 
1781 aa  54.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.13 
 
 
2377 aa  53.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.18 
 
 
761 aa  53.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.19 
 
 
846 aa  53.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  27.11 
 
 
2353 aa  53.5  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1063  hypothetical protein  24.58 
 
 
800 aa  53.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.417069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.97 
 
 
1512 aa  52.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  30.77 
 
 
2670 aa  52.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.53 
 
 
850 aa  52  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  30.99 
 
 
2402 aa  52  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  36.16 
 
 
1550 aa  52  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  25.87 
 
 
2636 aa  51.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  37.86 
 
 
530 aa  50.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  34.41 
 
 
539 aa  50.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  38.05 
 
 
556 aa  50.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  30.29 
 
 
1462 aa  50.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  24.08 
 
 
1408 aa  49.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  24.08 
 
 
1410 aa  49.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>