37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1063 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1063  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1608    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.417069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1069  hypothetical protein  35.29 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0756  hypothetical protein  32.71 
 
 		 351 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.918842  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.39 
 
 		 1597 aa  71.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.86 
 
 		 2816 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  24.18 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2636 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 1408 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 1410 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 1410 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.2 
 
 		 2377 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.85 
 
 		 4978 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  24.48 
 
 		 1779 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.89 
 
 		 994 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  25.76 
 
 		 1422 aa  58.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1061  hypothetical protein  26.98 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000629327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.67 
 
 		 761 aa  57.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.95 
 
 		 850 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.41 
 
 		 1771 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  24.58 
 
 		 2027 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.47 
 
 		 2656 aa  53.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  29.35 
 
 		 1367 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  24.23 
 
 		 2067 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.9 
 
 		 8321 aa  48.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  24.81 
 
 		 1363 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  28.78 
 
 		 2056 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  24.74 
 
 		 2084 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  37.36 
 
 		 539 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  31.36 
 
 		 2011 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  24.88 
 
 		 5745 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  25.73 
 
 		 892 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  24.31 
 
 		 393 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  24.66 
 
 		 1152 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1512 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  25.73 
 
 		 2040 aa  44.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.44 
 
 		 1092 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1416 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>