22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0874 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 674 aa  1353    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0586  hypothetical protein  40.82 
 
 		 568 aa  89  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  39.68 
 
 		 593 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1069  hypothetical protein  24 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1063  hypothetical protein  24.18 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.417069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.61 
 
 		 724 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.14 
 
 		 721 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0756  hypothetical protein  30.6 
 
 		 351 aa  55.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.918842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 		 835 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.11 
 
 		 835 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  32.71 
 
 		 818 aa  50.8  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2367  hypothetical protein  42.03 
 
 		 1360 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.574377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.51 
 
 		 835 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.71 
 
 		 836 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  31.36 
 
 		 1151 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  31.31 
 
 		 950 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4711  hypothetical protein  35.42 
 
 		 996 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  30.58 
 
 		 884 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  34.65 
 
 		 592 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2916  hypothetical protein  35.29 
 
 		 398 aa  44.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  27.74 
 
 		 868 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>