72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1165 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 950 aa  1863    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3939  NHL repeat-containing protein  30.47 
 
 		 454 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0801194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1014  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 		 444 aa  130  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00195026  normal  0.319723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2367  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1360 aa  90.1  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.574377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1841  hypothetical protein  27.32 
 
 		 796 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.76 
 
 		 721 aa  74.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  43.53 
 
 		 724 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1030 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  30.42 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  29.56 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  29.44 
 
 		 621 aa  61.6  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.74 
 
 		 930 aa  61.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  21.58 
 
 		 831 aa  58.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.23 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0586  hypothetical protein  42.45 
 
 		 568 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.13 
 
 		 522 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  26.76 
 
 		 1046 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.23 
 
 		 1140 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1750 aa  56.2  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  22.68 
 
 		 668 aa  56.2  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1051 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.02 
 
 		 1292 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  35.94 
 
 		 658 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.23 
 
 		 676 aa  55.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  23.39 
 
 		 627 aa  54.7  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  29.66 
 
 		 673 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.6 
 
 		 963 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.25 
 
 		 579 aa  54.3  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  24.21 
 
 		 346 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  27.86 
 
 		 346 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  22.4 
 
 		 646 aa  53.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  25.44 
 
 		 709 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25.28 
 
 		 850 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.22 
 
 		 664 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1629  hypothetical protein  40.22 
 
 		 506 aa  51.6  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.931665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2916  hypothetical protein  27.04 
 
 		 398 aa  51.6  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1351 aa  51.2  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  25.48 
 
 		 343 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1763 aa  50.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.95 
 
 		 693 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  24.29 
 
 		 930 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.58 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 717 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1026 aa  48.5  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.88 
 
 		 395 aa  48.5  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 491 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  23.88 
 
 		 447 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.25 
 
 		 786 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  23.44 
 
 		 448 aa  47  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.42 
 
 		 1130 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.11 
 
 		 2296 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1030 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  22.74 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  22.74 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  22.74 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.81 
 
 		 752 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  22.74 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  22.74 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  22.74 
 
 		 657 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  27.66 
 
 		 416 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  26.53 
 
 		 359 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.76 
 
 		 927 aa  45.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  21.5 
 
 		 892 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  45.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1449  hypothetical protein  23.87 
 
 		 820 aa  45.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.669353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  29.91 
 
 		 667 aa  45.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.86 
 
 		 307 aa  45.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.81 
 
 		 343 aa  44.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  27.34 
 
 		 455 aa  44.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  22.43 
 
 		 657 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.7 
 
 		 1147 aa  44.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  31.11 
 
 		 691 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>