192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2554 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  100 
 
 		 1363 aa  2736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  56.37 
 
 		 1367 aa  1550    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2330  hypothetical protein  51.82 
 
 		 623 aa  596  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.865327  normal  0.0759502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2271  hypothetical protein  56.05 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.846725  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  40.08 
 
 		 1597 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.35 
 
 		 2816 aa  243  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.36 
 
 		 5745 aa  234  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  32.46 
 
 		 1269 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.83 
 
 		 4978 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  29.32 
 
 		 1268 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.1 
 
 		 3477 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  29.18 
 
 		 1269 aa  209  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.75 
 
 		 994 aa  204  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.55 
 
 		 2114 aa  195  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  31.6 
 
 		 892 aa  194  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.21 
 
 		 4848 aa  191  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  33.87 
 
 		 721 aa  189  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  26.68 
 
 		 722 aa  189  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.78 
 
 		 3191 aa  184  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.62 
 
 		 2839 aa  183  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.17 
 
 		 3363 aa  180  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.1 
 
 		 1884 aa  179  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.39 
 
 		 2074 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  29.2 
 
 		 3927 aa  174  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.35 
 
 		 2767 aa  170  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.12 
 
 		 850 aa  167  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  29.13 
 
 		 3474 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.45 
 
 		 3816 aa  153  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.44 
 
 		 9867 aa  151  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 761 aa  145  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.47 
 
 		 16322 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1061 aa  132  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.78 
 
 		 4122 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.7 
 
 		 2377 aa  125  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.71 
 
 		 2153 aa  123  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1512 aa  121  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  27.43 
 
 		 2027 aa  119  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  25.33 
 
 		 2056 aa  119  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  26.51 
 
 		 2051 aa  119  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  26.5 
 
 		 2039 aa  115  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.43 
 
 		 814 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  31.4 
 
 		 1215 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  31.4 
 
 		 1215 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 		 4220 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 1408 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 1410 aa  111  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 1410 aa  111  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  24.63 
 
 		 2067 aa  110  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  24.64 
 
 		 1422 aa  109  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  38.46 
 
 		 2503 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.76 
 
 		 3699 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  28 
 
 		 3089 aa  103  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  37.3 
 
 		 3699 aa  103  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.3 
 
 		 3544 aa  102  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  36.22 
 
 		 2522 aa  101  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.07 
 
 		 1502 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  24.08 
 
 		 2040 aa  101  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.97 
 
 		 2476 aa  99  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  36.76 
 
 		 1911 aa  99  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  25.31 
 
 		 4854 aa  98.2  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1416 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  25.24 
 
 		 2555 aa  96.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 		 1215 aa  93.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  39.31 
 
 		 8321 aa  92.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.5 
 
 		 1867 aa  92.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  25.53 
 
 		 2084 aa  91.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 		 1215 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 		 1215 aa  90.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.69 
 
 		 369 aa  88.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  22.61 
 
 		 2011 aa  85.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1066 aa  85.1  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1744 aa  84.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  35.57 
 
 		 2670 aa  84  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.07 
 
 		 809 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.18 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.18 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.07 
 
 		 2507 aa  82  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  28.25 
 
 		 994 aa  81.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.82 
 
 		 823 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  26.31 
 
 		 1706 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  39.64 
 
 		 807 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  30.53 
 
 		 663 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  23.48 
 
 		 2052 aa  79.7  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  33.89 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.94 
 
 		 819 aa  79  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  33.76 
 
 		 2715 aa  79  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.94 
 
 		 819 aa  79  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.94 
 
 		 819 aa  79  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.94 
 
 		 819 aa  79  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.02 
 
 		 1712 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.67 
 
 		 2807 aa  78.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1109 aa  77.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.18 
 
 		 807 aa  75.5  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  27.98 
 
 		 1151 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  26.43 
 
 		 2353 aa  73.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.17 
 
 		 807 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  27.93 
 
 		 1428 aa  72.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  44.79 
 
 		 1394 aa  71.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.66 
 
 		 1158 aa  71.6  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.39 
 
 		 803 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>