292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0105 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  100 
 
 		 1597 aa  3133    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  46.77 
 
 		 5745 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  46.73 
 
 		 4978 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.22 
 
 		 1884 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  46.49 
 
 		 2816 aa  340  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  44.02 
 
 		 1269 aa  338  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  41.88 
 
 		 1268 aa  331  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  42.23 
 
 		 1269 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.1 
 
 		 3191 aa  320  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  38 
 
 		 1367 aa  318  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  37.95 
 
 		 3927 aa  317  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  46.35 
 
 		 3477 aa  312  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  42.6 
 
 		 3474 aa  308  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  40.08 
 
 		 1363 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.52 
 
 		 2114 aa  303  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  43.84 
 
 		 4848 aa  300  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  41.56 
 
 		 721 aa  297  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  41.58 
 
 		 2839 aa  297  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  39.93 
 
 		 2377 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  38.18 
 
 		 892 aa  290  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.91 
 
 		 994 aa  290  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  33.92 
 
 		 2767 aa  280  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.78 
 
 		 3816 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.94 
 
 		 4220 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  36.4 
 
 		 2074 aa  263  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  36.26 
 
 		 4854 aa  259  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  41.13 
 
 		 16322 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.87 
 
 		 850 aa  251  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.56 
 
 		 4836 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.72 
 
 		 2555 aa  241  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.05 
 
 		 4122 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  34.67 
 
 		 1867 aa  232  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  31.13 
 
 		 1706 aa  228  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.18 
 
 		 2812 aa  227  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  40.81 
 
 		 814 aa  223  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.31 
 
 		 3363 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1512 aa  204  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.76 
 
 		 761 aa  195  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.19 
 
 		 5787 aa  194  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.1 
 
 		 5839 aa  193  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  33.66 
 
 		 5442 aa  192  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  33.78 
 
 		 1428 aa  190  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  33.56 
 
 		 4791 aa  189  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.88 
 
 		 2507 aa  184  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  32.97 
 
 		 7284 aa  181  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  34.02 
 
 		 2768 aa  178  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  45.37 
 
 		 1538 aa  172  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.56 
 
 		 3089 aa  171  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.2 
 
 		 8321 aa  169  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.62 
 
 		 2807 aa  169  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1949 aa  162  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  35.9 
 
 		 1215 aa  161  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  35.9 
 
 		 1215 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  33.43 
 
 		 4285 aa  159  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  52.02 
 
 		 1502 aa  158  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 1215 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 1215 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 1215 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.35 
 
 		 5020 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.02 
 
 		 1599 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.86 
 
 		 1066 aa  147  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  34.71 
 
 		 2153 aa  146  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1416 aa  145  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.3 
 
 		 1109 aa  145  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  32.05 
 
 		 1408 aa  142  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  32.88 
 
 		 1410 aa  142  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  32.88 
 
 		 1410 aa  142  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1061 aa  140  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  29.56 
 
 		 2067 aa  139  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.6 
 
 		 369 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.72 
 
 		 9867 aa  135  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.47 
 
 		 6779 aa  135  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.47 
 
 		 6683 aa  135  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.22 
 
 		 3508 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.51 
 
 		 3699 aa  131  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  31.3 
 
 		 6662 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.25 
 
 		 1063 aa  130  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.25 
 
 		 3714 aa  130  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.29 
 
 		 3699 aa  129  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 1422 aa  129  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.01 
 
 		 1141 aa  129  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  27 
 
 		 3182 aa  128  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.91 
 
 		 7149 aa  126  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1744 aa  125  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  32.06 
 
 		 5769 aa  125  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1752 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1806 aa  124  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.68 
 
 		 3544 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 3396 aa  123  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.93 
 
 		 16311 aa  122  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.67 
 
 		 1712 aa  121  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  36.84 
 
 		 663 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  29.58 
 
 		 5094 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  29.84 
 
 		 2056 aa  120  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  37.23 
 
 		 2890 aa  119  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  35.2 
 
 		 2503 aa  119  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 2027 aa  119  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  30.83 
 
 		 2476 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  27.94 
 
 		 2051 aa  116  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  39.67 
 
 		 2522 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>