32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1330 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
1052 aa  2047    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  34.7 
 
 
2069 aa  373  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  31.59 
 
 
2067 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  29.9 
 
 
2011 aa  271  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  29.29 
 
 
2040 aa  271  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  31.52 
 
 
2056 aa  265  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  30.19 
 
 
2051 aa  252  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  28.35 
 
 
2027 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  30.88 
 
 
2084 aa  232  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  30.54 
 
 
2039 aa  228  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  33.09 
 
 
2052 aa  224  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  31.05 
 
 
2047 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  30.46 
 
 
1994 aa  197  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  29.38 
 
 
2043 aa  193  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  31.83 
 
 
864 aa  92  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  31.66 
 
 
865 aa  86.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.13 
 
 
1628 aa  73.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  27.75 
 
 
9585 aa  65.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  30.52 
 
 
2042 aa  62.4  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  29.59 
 
 
1879 aa  62  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.14 
 
 
2192 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.83 
 
 
1462 aa  54.7  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  29.79 
 
 
725 aa  53.5  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  26.21 
 
 
744 aa  51.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  25.56 
 
 
1221 aa  47.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  30.13 
 
 
721 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  25.83 
 
 
2286 aa  47.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  36.67 
 
 
1916 aa  45.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  36.59 
 
 
831 aa  45.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  24.71 
 
 
454 aa  45.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  28.19 
 
 
692 aa  45.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  32.02 
 
 
822 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>