91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2716 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1075    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  46.31 
 
 		 539 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  43.85 
 
 		 519 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  44.8 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  43.46 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  38.65 
 
 		 556 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  37.46 
 
 		 563 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 1502 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1006 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 2067 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  36.54 
 
 		 994 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 		 2027 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  40.2 
 
 		 2039 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  38.3 
 
 		 3089 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  37.27 
 
 		 1131 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  41.67 
 
 		 721 aa  54.3  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.52 
 
 		 2346 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  24.6 
 
 		 394 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  45.16 
 
 		 892 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  35.35 
 
 		 2056 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  38.14 
 
 		 1394 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  27.37 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  22.99 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  41.24 
 
 		 4848 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  22.5 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  35.34 
 
 		 755 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  34.48 
 
 		 743 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  38.46 
 
 		 2503 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1781 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  20.68 
 
 		 453 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 		 3699 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.36 
 
 		 3699 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.71 
 
 		 814 aa  50.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  34.48 
 
 		 743 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.96 
 
 		 1066 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  25.36 
 
 		 742 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1752 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  37.27 
 
 		 1215 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  39.39 
 
 		 2670 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.27 
 
 		 1215 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  24.78 
 
 		 743 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2069 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  36.56 
 
 		 1911 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  21.79 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 1215 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.78 
 
 		 799 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  35.56 
 
 		 1597 aa  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  28.19 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  37.27 
 
 		 1215 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.79 
 
 		 4122 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  27.88 
 
 		 2084 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  37.27 
 
 		 1215 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1126 aa  47.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  25.7 
 
 		 708 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  37.78 
 
 		 2522 aa  47.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1131 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  40 
 
 		 3477 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  35.05 
 
 		 2047 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  33.62 
 
 		 743 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  23.18 
 
 		 1367 aa  47  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.95 
 
 		 761 aa  47  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  41.67 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  25.29 
 
 		 656 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.89 
 
 		 994 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  33.58 
 
 		 180 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  43.66 
 
 		 2353 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  41.67 
 
 		 678 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  23.45 
 
 		 709 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.56 
 
 		 3544 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 		 1131 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  35.71 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  41.67 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  32.48 
 
 		 744 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  22.54 
 
 		 650 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  40 
 
 		 1022 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  38.33 
 
 		 709 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  21.32 
 
 		 755 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  22.76 
 
 		 709 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  23.1 
 
 		 709 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  41.89 
 
 		 886 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  22.17 
 
 		 652 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  29.41 
 
 		 2051 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  38.98 
 
 		 676 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 3816 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  34.15 
 
 		 2040 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.82 
 
 		 850 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.1 
 
 		 2114 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  21.07 
 
 		 758 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  34.41 
 
 		 2848 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  22.76 
 
 		 709 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  22.62 
 
 		 656 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>