91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2366 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  97.98 
 
 		 755 aa  1304    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  90.71 
 
 		 743 aa  1233    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  69.49 
 
 		 744 aa  969    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  86.27 
 
 		 743 aa  1235    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  100 
 
 		 743 aa  1469    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  49.2 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  44.49 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  44.49 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  44.49 
 
 		 442 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  43.64 
 
 		 442 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  36.77 
 
 		 720 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  58.39 
 
 		 1131 aa  170  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  49.48 
 
 		 1131 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  47.92 
 
 		 1131 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  33.51 
 
 		 825 aa  150  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  31.56 
 
 		 836 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  32.81 
 
 		 448 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 841 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  31.65 
 
 		 467 aa  122  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  28.44 
 
 		 470 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  37.78 
 
 		 1597 aa  89  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  35.4 
 
 		 721 aa  87  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  29.63 
 
 		 1367 aa  82  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.53 
 
 		 2816 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.65 
 
 		 3477 aa  78.2  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.2 
 
 		 3363 aa  76.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  33.78 
 
 		 722 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35.84 
 
 		 3474 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  26.46 
 
 		 9867 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  38.27 
 
 		 1269 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.98 
 
 		 1502 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.57 
 
 		 5745 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  38 
 
 		 1269 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.68 
 
 		 2114 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  37.89 
 
 		 1268 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1744 aa  68.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 		 2839 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.18 
 
 		 1066 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.63 
 
 		 4978 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.82 
 
 		 3699 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  32.62 
 
 		 2503 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33.62 
 
 		 2377 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.28 
 
 		 3699 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  27.14 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1512 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.88 
 
 		 3191 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  33.82 
 
 		 1215 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  33.82 
 
 		 1215 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  30.56 
 
 		 892 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  34.12 
 
 		 1363 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1416 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.15 
 
 		 2476 aa  56.6  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.84 
 
 		 1215 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 		 850 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2522 aa  54.3  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.51 
 
 		 2807 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.43 
 
 		 3089 aa  52.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.22 
 
 		 994 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 		 1215 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.43 
 
 		 3816 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 		 1215 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  31.68 
 
 		 1911 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.39 
 
 		 814 aa  52  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  32.18 
 
 		 2047 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  39.64 
 
 		 1394 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 		 2555 aa  51.2  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  34.24 
 
 		 1706 aa  50.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  34.39 
 
 		 1428 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  34.48 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  25.33 
 
 		 8321 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.47 
 
 		 3544 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  35.92 
 
 		 3471 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2767 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.6 
 
 		 761 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  38.14 
 
 		 4748 aa  48.5  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  30.13 
 
 		 2051 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  31.51 
 
 		 2011 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 		 2056 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  35.83 
 
 		 2848 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 2040 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  29.31 
 
 		 2067 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  27.72 
 
 		 2069 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.02 
 
 		 4854 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.31 
 
 		 4122 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  37.23 
 
 		 539 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  37.07 
 
 		 2153 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6118  hypothetical protein  33.05 
 
 		 393 aa  45.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2653  hypothetical protein  29.02 
 
 		 676 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135557  normal  0.0988839 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1781 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6119  hypothetical protein  35.19 
 
 		 390 aa  43.9  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.48 
 
 		 1292 aa  43.9  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>