37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0479 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  86.39 
 
 
678 aa  1222    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  51.29 
 
 
690 aa  711    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  53.33 
 
 
645 aa  700    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  50.32 
 
 
652 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  50 
 
 
650 aa  653    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  95.87 
 
 
678 aa  1356    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  78.24 
 
 
676 aa  1093    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  70.23 
 
 
687 aa  994    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  78.68 
 
 
676 aa  1098    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  100 
 
 
678 aa  1432    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  78.24 
 
 
676 aa  1094    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  50.43 
 
 
688 aa  682    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  50.44 
 
 
664 aa  712    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  53.44 
 
 
656 aa  714    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  66.62 
 
 
709 aa  966    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  50.16 
 
 
656 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  68.68 
 
 
709 aa  991    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  68.54 
 
 
709 aa  990    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  68.26 
 
 
709 aa  983    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  67.28 
 
 
709 aa  972    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  78.24 
 
 
679 aa  1115    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  66.99 
 
 
709 aa  956    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  26.14 
 
 
563 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.13 
 
 
799 aa  57.4  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  22.8 
 
 
556 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  27.73 
 
 
286 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  30.18 
 
 
287 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  41.67 
 
 
516 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  20.75 
 
 
539 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  28.57 
 
 
639 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  22.75 
 
 
458 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  27.95 
 
 
340 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  24.08 
 
 
456 aa  44.3  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  24.37 
 
 
469 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  26.63 
 
 
315 aa  44.3  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  23.18 
 
 
536 aa  43.9  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  22 
 
 
742 aa  43.9  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>