37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3364 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  88.12 
 
 		 709 aa  1307    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  49.44 
 
 		 690 aa  714    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  55.87 
 
 		 645 aa  734    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  51.1 
 
 		 652 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  51.26 
 
 		 650 aa  670    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  66.43 
 
 		 678 aa  954    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  67.79 
 
 		 676 aa  984    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  84.2 
 
 		 687 aa  1229    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  68.31 
 
 		 676 aa  989    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  66.99 
 
 		 678 aa  956    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  68.17 
 
 		 676 aa  983    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  66.76 
 
 		 678 aa  963    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  50.96 
 
 		 688 aa  689    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  90.41 
 
 		 709 aa  1337    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  90.69 
 
 		 709 aa  1343    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  90.41 
 
 		 709 aa  1340    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  90.55 
 
 		 709 aa  1344    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  54.33 
 
 		 664 aa  719    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  51.26 
 
 		 656 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  53.63 
 
 		 656 aa  754    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  69.72 
 
 		 679 aa  1008    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  100 
 
 		 709 aa  1489    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  23.42 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.02 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  21.41 
 
 		 539 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 		 799 aa  48.9  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  23.04 
 
 		 536 aa  48.5  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  23.35 
 
 		 755 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  27.57 
 
 		 286 aa  47.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  38.81 
 
 		 469 aa  47.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  25.88 
 
 		 519 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 537 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  21.85 
 
 		 425 aa  45.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  38.33 
 
 		 516 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  23.67 
 
 		 708 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  25 
 
 		 418 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.34 
 
 		 884 aa  44.3  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>