35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0015 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  55.86 
 
 
656 aa  716    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  62.61 
 
 
645 aa  864    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  55.86 
 
 
652 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  55.54 
 
 
650 aa  717    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  50.78 
 
 
678 aa  691    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  53.59 
 
 
676 aa  701    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  53.64 
 
 
687 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  52.72 
 
 
676 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  49.7 
 
 
678 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  50.37 
 
 
676 aa  690    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  51.83 
 
 
678 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  51.92 
 
 
709 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  100 
 
 
664 aa  1399    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  53.61 
 
 
709 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  54.33 
 
 
709 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  54 
 
 
709 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  51.51 
 
 
679 aa  702    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  63.39 
 
 
656 aa  913    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  54.16 
 
 
709 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  54.16 
 
 
709 aa  700    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  45.47 
 
 
690 aa  588  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  44.15 
 
 
688 aa  560  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  24.65 
 
 
425 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.64 
 
 
784 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  22.55 
 
 
556 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  25.88 
 
 
563 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
537 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  24.48 
 
 
408 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  25.36 
 
 
259 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 
687 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.25 
 
 
651 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 
781 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  22.61 
 
 
394 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  22.63 
 
 
1009 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  24.53 
 
 
1143 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>