36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0806 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  55.17 
 
 		 709 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  100 
 
 		 645 aa  1359    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  56.98 
 
 		 652 aa  731    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  57.14 
 
 		 650 aa  729    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  52.74 
 
 		 678 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  53.45 
 
 		 676 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  56.11 
 
 		 687 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  53.77 
 
 		 676 aa  697    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  52.54 
 
 		 678 aa  698    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  53.29 
 
 		 676 aa  685    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  53.39 
 
 		 678 aa  693    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  62.61 
 
 		 664 aa  882    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  55.56 
 
 		 709 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  55.87 
 
 		 709 aa  731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  54.41 
 
 		 679 aa  698    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  57.67 
 
 		 656 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  80.65 
 
 		 656 aa  1083    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  54.86 
 
 		 709 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  55.02 
 
 		 709 aa  718    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  55.17 
 
 		 709 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  48.75 
 
 		 690 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  47.74 
 
 		 688 aa  587  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  23.76 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  26.29 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  24.13 
 
 		 556 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.04 
 
 		 651 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  24.79 
 
 		 469 aa  51.6  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.85 
 
 		 784 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 537 aa  47.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 		 755 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  38.33 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  26.15 
 
 		 391 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  22.36 
 
 		 536 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  24.8 
 
 		 394 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  26.56 
 
 		 658 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  26.89 
 
 		 349 aa  43.9  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>