50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0313 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  860    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  47.63 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  34.96 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 654 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 771 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.25 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  25.21 
 
 		 758 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  22.49 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  24.53 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  24.5 
 
 		 755 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 764 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.25 
 
 		 651 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  23.23 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  22.97 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  22.04 
 
 		 817 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.73 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 687 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  21.01 
 
 		 743 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 		 773 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  20.29 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  23.08 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 		 828 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  22.37 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 781 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  22.73 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  21.15 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.28 
 
 		 784 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 802 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  25.33 
 
 		 563 aa  53.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  27.37 
 
 		 516 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.28 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  27.54 
 
 		 656 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  27.54 
 
 		 652 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  27.54 
 
 		 650 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  22.75 
 
 		 536 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 		 764 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  25.97 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  22.63 
 
 		 469 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  20.83 
 
 		 742 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  26.53 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  24.48 
 
 		 664 aa  47.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  24.66 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 		 729 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  22.63 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  22.67 
 
 		 708 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  22.83 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  25.89 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  25 
 
 		 656 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  23.68 
 
 		 577 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>