40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3601 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  801    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  52.77 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 537 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 654 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  28.1 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  24.72 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  24.47 
 
 		 773 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  23.34 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.37 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.2 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  26.78 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  23.56 
 
 		 758 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  23.89 
 
 		 519 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 764 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  25.21 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  26.7 
 
 		 640 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  23.72 
 
 		 651 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  24.88 
 
 		 708 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.37 
 
 		 974 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  23.44 
 
 		 767 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  26.29 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 764 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  40.91 
 
 		 148 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.28 
 
 		 556 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  38.75 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  27.35 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  27.22 
 
 		 690 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 781 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  22.67 
 
 		 817 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  30 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  23.68 
 
 		 741 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  39.06 
 
 		 153 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  26.44 
 
 		 755 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  24.74 
 
 		 688 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  31.11 
 
 		 697 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  28.77 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  24.64 
 
 		 593 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  28 
 
 		 240 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>