42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2918 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  982    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  62.5 
 
 		 536 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  61.76 
 
 		 539 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  47.79 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  43.46 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  40.78 
 
 		 556 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  38.39 
 
 		 563 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.94 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 687 aa  54.3  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  21.1 
 
 		 425 aa  53.5  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  27.75 
 
 		 656 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  23.2 
 
 		 778 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  22.86 
 
 		 742 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  27.62 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 764 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 802 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  41.79 
 
 		 687 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  22.81 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  20.63 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  22.89 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  24.23 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  22.63 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  24.41 
 
 		 755 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 537 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  38.81 
 
 		 709 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 758 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  36.36 
 
 		 709 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  36.36 
 
 		 709 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  36.36 
 
 		 709 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  26.79 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  25.67 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 764 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 771 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  24.79 
 
 		 645 aa  44.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  23.65 
 
 		 743 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.84 
 
 		 784 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.28 
 
 		 799 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  34.85 
 
 		 709 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  34.85 
 
 		 709 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  27.35 
 
 		 590 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  22.94 
 
 		 577 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>