86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3259 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1118    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  74.35 
 
 		 539 aa  791    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  62.74 
 
 		 469 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  45.54 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  46.21 
 
 		 519 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  40.99 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  38.64 
 
 		 563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  40 
 
 		 1126 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  47.25 
 
 		 2503 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  39.78 
 
 		 994 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  47.25 
 
 		 3699 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.35 
 
 		 3699 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  24.33 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  41.41 
 
 		 3089 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  45.56 
 
 		 3544 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  46.07 
 
 		 2522 aa  63.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  40.4 
 
 		 1911 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  39.82 
 
 		 1215 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.82 
 
 		 1215 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  43.33 
 
 		 2476 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  38.05 
 
 		 1215 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  38.05 
 
 		 1215 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  38.05 
 
 		 1215 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  40.62 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  31.97 
 
 		 2067 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.22 
 
 		 814 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  38.1 
 
 		 1131 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  30.67 
 
 		 2056 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.65 
 
 		 3816 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.37 
 
 		 4848 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.55 
 
 		 761 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  38.46 
 
 		 2848 aa  53.9  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  31.97 
 
 		 1131 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  39.6 
 
 		 892 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  41.11 
 
 		 1367 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  26.8 
 
 		 1394 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1781 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  38.46 
 
 		 721 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  22.89 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 537 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  36.67 
 
 		 1502 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  23.22 
 
 		 408 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  41.1 
 
 		 2839 aa  50.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.36 
 
 		 850 aa  50.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 764 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 687 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  26.74 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  35.05 
 
 		 2027 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.36 
 
 		 994 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  35.65 
 
 		 2153 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1752 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  26.25 
 
 		 2051 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  37.25 
 
 		 2084 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 654 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1006 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1131 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.41 
 
 		 846 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  37.97 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  29.01 
 
 		 2039 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  25.3 
 
 		 743 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  22.55 
 
 		 778 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  35 
 
 		 1066 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  21.27 
 
 		 403 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  45.83 
 
 		 2353 aa  47  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.3 
 
 		 1712 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.77 
 
 		 1597 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 		 2346 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  36.96 
 
 		 1022 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  20.7 
 
 		 781 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  22.08 
 
 		 650 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  21.67 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  31.82 
 
 		 2069 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1512 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  41.67 
 
 		 1883 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.48 
 
 		 2114 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3639  cytochrome C family protein  26.04 
 
 		 353 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0348181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  29.69 
 
 		 1287 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  21.91 
 
 		 758 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  23.38 
 
 		 709 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  23.08 
 
 		 742 aa  44.3  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  30.63 
 
 		 640 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.66 
 
 		 1236 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  21 
 
 		 651 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2047 aa  43.5  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  21.86 
 
 		 656 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  39.36 
 
 		 2670 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>