More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2854 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 654 aa  1372    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 537 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  27.92 
 
 		 408 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  27.47 
 
 		 386 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  29.01 
 
 		 403 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  26.55 
 
 		 425 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  24.17 
 
 		 386 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  24.18 
 
 		 383 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  26.18 
 
 		 755 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  25.6 
 
 		 640 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  22.91 
 
 		 758 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  25.36 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 		 781 aa  73.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  22.08 
 
 		 651 aa  73.9  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  21.79 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  23.37 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 968 aa  68.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  21.75 
 
 		 778 aa  67.8  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 4079 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 802 aa  65.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  24.41 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 771 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  22.69 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 3145 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  21.84 
 
 		 708 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1276 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 626 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.5 
 
 		 725 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 614 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.41 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 1694 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 3035 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  22.98 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.22 
 
 		 622 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  29.19 
 
 		 246 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 565 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  26.98 
 
 		 202 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.24 
 
 		 292 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  20.06 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.45 
 
 		 707 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 399 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 287 aa  55.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 626 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 693 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  23.1 
 
 		 773 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1297 aa  55.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 376 aa  55.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.77 
 
 		 887 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 878 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 279 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 4489 aa  54.7  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 827 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  21.56 
 
 		 453 aa  54.7  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  27.95 
 
 		 299 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 217 aa  54.7  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  25.82 
 
 		 299 aa  54.7  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 828 aa  54.7  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 750 aa  54.3  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.79 
 
 		 816 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 566 aa  53.9  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 356 aa  53.9  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.54 
 
 		 739 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  22.76 
 
 		 764 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.16 
 
 		 1007 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 715 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 615 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 573 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 		 1094 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  21.07 
 
 		 817 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 		 436 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 750 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 927 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31719  peroxisomal targeting signal 1 receptor  26.92 
 
 		 712 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0456101  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1069 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  21.97 
 
 		 635 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  22.09 
 
 		 661 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 662 aa  52.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 639 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.51 
 
 		 739 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.69 
 
 		 779 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 363 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  20.78 
 
 		 568 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>