121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0237 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0236  cellulose-binding domain-containing protein  60.89 
 
 
555 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0610362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  100 
 
 
1006 aa  2055    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1422  hypothetical protein  38.61 
 
 
617 aa  379  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.943384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  36.84 
 
 
740 aa  357  5e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2405  hypothetical protein  32.78 
 
 
845 aa  286  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  41.25 
 
 
1394 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2375  hypothetical protein  25.71 
 
 
517 aa  154  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213672  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  30.15 
 
 
1752 aa  127  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  31.07 
 
 
1781 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.5 
 
 
1597 aa  115  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  26.82 
 
 
1744 aa  108  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.02 
 
 
4978 aa  101  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.93 
 
 
2767 aa  100  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1824  hypothetical protein  38.03 
 
 
435 aa  96.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  28.09 
 
 
721 aa  95.9  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.98 
 
 
5745 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1081  hypothetical protein  33.33 
 
 
853 aa  93.6  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.17 
 
 
1066 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  38.1 
 
 
16322 aa  79  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  48.96 
 
 
5769 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  25.66 
 
 
1512 aa  78.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  25.77 
 
 
1367 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  45.36 
 
 
5444 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  23.92 
 
 
2816 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.93 
 
 
3191 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.75 
 
 
4122 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.92 
 
 
761 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.29 
 
 
1884 aa  73.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  46.81 
 
 
1712 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  42.71 
 
 
663 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  35.51 
 
 
1538 aa  73.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.6 
 
 
850 aa  73.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.9 
 
 
994 aa  71.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.08 
 
 
3816 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47 
 
 
1236 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  23.82 
 
 
2353 aa  68.2  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.12 
 
 
3927 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  40.96 
 
 
1022 aa  65.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 
2114 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.16 
 
 
2346 aa  65.1  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  36.45 
 
 
2848 aa  65.1  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  24.58 
 
 
1363 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.16 
 
 
2377 aa  64.7  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  37.5 
 
 
2522 aa  64.7  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  27.52 
 
 
8321 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  39.69 
 
 
1502 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  25.81 
 
 
2555 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02460  hypothetical protein  33 
 
 
795 aa  63.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 
1268 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  39.58 
 
 
3544 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  35.71 
 
 
1416 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.28 
 
 
892 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.9 
 
 
1706 aa  61.6  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  35.14 
 
 
3699 aa  61.6  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  24.72 
 
 
2067 aa  61.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  38.37 
 
 
653 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  35.14 
 
 
2503 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  39.58 
 
 
2670 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  24.22 
 
 
1269 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  25.42 
 
 
3474 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 
982 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  24.65 
 
 
1269 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  37.21 
 
 
653 aa  59.3  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  34.78 
 
 
1518 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  37.21 
 
 
653 aa  58.9  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  37.1 
 
 
516 aa  58.9  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
3699 aa  58.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.08 
 
 
3089 aa  58.2  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  41.41 
 
 
4848 aa  58.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  35.42 
 
 
1911 aa  58.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  24.29 
 
 
814 aa  58.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  36.89 
 
 
4854 aa  57.4  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  33.65 
 
 
2476 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 
1287 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  39.58 
 
 
2839 aa  57  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.92 
 
 
2807 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  30.67 
 
 
1215 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.67 
 
 
1215 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  31.86 
 
 
974 aa  55.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.93 
 
 
3363 aa  53.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.24 
 
 
3396 aa  53.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  35.11 
 
 
1126 aa  52.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.56 
 
 
2145 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  41.54 
 
 
3486 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  38.1 
 
 
3477 aa  51.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  25.07 
 
 
2153 aa  50.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  32.69 
 
 
1141 aa  50.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.48 
 
 
2812 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.36 
 
 
4220 aa  50.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0994  hypothetical protein  24.48 
 
 
1032 aa  50.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  34.65 
 
 
539 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  32.46 
 
 
722 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  29.01 
 
 
4748 aa  49.3  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  25.12 
 
 
2056 aa  49.3  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  35 
 
 
1867 aa  48.9  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.96 
 
 
1215 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  37.96 
 
 
1215 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  35.64 
 
 
1215 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.04 
 
 
1883 aa  48.5  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.5 
 
 
2812 aa  48.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>