216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3150 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  100 
 
 		 2670 aa  5341    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.02 
 
 		 3699 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.53 
 
 		 3699 aa  484  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.72 
 
 		 3544 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  36.52 
 
 		 2522 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.14 
 
 		 2839 aa  466  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  36.06 
 
 		 2503 aa  466  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.02 
 
 		 2476 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  34.74 
 
 		 1911 aa  429  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.44 
 
 		 3089 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.53 
 
 		 3816 aa  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.97 
 
 		 2153 aa  407  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  46.26 
 
 		 3477 aa  374  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  32.66 
 
 		 2715 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  29.89 
 
 		 1575 aa  325  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  33.13 
 
 		 933 aa  315  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  29.96 
 
 		 2415 aa  270  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  43.69 
 
 		 331 aa  238  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  36.22 
 
 		 907 aa  233  3e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  40.49 
 
 		 1038 aa  233  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  37.57 
 
 		 486 aa  228  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.32 
 
 		 1480 aa  217  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  32.9 
 
 		 647 aa  209  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  35.57 
 
 		 3060 aa  206  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  41.94 
 
 		 427 aa  204  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  39.55 
 
 		 634 aa  199  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  36.67 
 
 		 500 aa  199  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  33.58 
 
 		 399 aa  193  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.97 
 
 		 3562 aa  192  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  36.75 
 
 		 558 aa  191  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  33.23 
 
 		 467 aa  190  4e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  39.22 
 
 		 741 aa  185  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  32.85 
 
 		 497 aa  184  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  42.92 
 
 		 934 aa  179  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  29.27 
 
 		 1362 aa  177  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  43.93 
 
 		 253 aa  172  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  43.64 
 
 		 323 aa  172  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  34.11 
 
 		 857 aa  170  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  40.34 
 
 		 377 aa  167  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  47.85 
 
 		 300 aa  166  6e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  35.21 
 
 		 862 aa  163  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  41.99 
 
 		 754 aa  159  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  35.53 
 
 		 279 aa  158  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  48.86 
 
 		 250 aa  157  2.9999999999999998e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  48.35 
 
 		 250 aa  156  4e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  37.39 
 
 		 450 aa  156  5e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  37.6 
 
 		 609 aa  155  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  30.24 
 
 		 898 aa  155  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  27.27 
 
 		 2848 aa  155  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  38.4 
 
 		 451 aa  154  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  34.75 
 
 		 789 aa  152  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  50.59 
 
 		 251 aa  152  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  30.87 
 
 		 395 aa  151  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  32.32 
 
 		 862 aa  151  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  40.44 
 
 		 982 aa  147  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  45.06 
 
 		 800 aa  146  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  48.75 
 
 		 309 aa  145  8e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  36.09 
 
 		 452 aa  145  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  42.94 
 
 		 1214 aa  142  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 414 aa  141  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  36.86 
 
 		 414 aa  140  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  48.03 
 
 		 226 aa  140  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  38.76 
 
 		 762 aa  140  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  45.61 
 
 		 272 aa  139  7.000000000000001e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  39.67 
 
 		 399 aa  139  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  36.45 
 
 		 774 aa  136  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  46.71 
 
 		 226 aa  135  7.999999999999999e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  48.44 
 
 		 509 aa  135  7.999999999999999e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  48.67 
 
 		 173 aa  135  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.96 
 
 		 1227 aa  133  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  39.77 
 
 		 275 aa  132  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  41.36 
 
 		 405 aa  132  8.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  35.38 
 
 		 521 aa  127  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  46.81 
 
 		 180 aa  121  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  35.91 
 
 		 658 aa  118  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  35.57 
 
 		 204 aa  115  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  32.16 
 
 		 200 aa  112  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  34.12 
 
 		 809 aa  111  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.77 
 
 		 3736 aa  109  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  41.18 
 
 		 321 aa  105  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  24.14 
 
 		 3278 aa  105  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  44.44 
 
 		 228 aa  102  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  41.4 
 
 		 4848 aa  101  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  52.87 
 
 		 913 aa  100  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  35.57 
 
 		 1363 aa  98.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  38.25 
 
 		 1367 aa  96.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  29.18 
 
 		 3734 aa  96.3  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  53.95 
 
 		 496 aa  95.9  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  40.56 
 
 		 423 aa  93.2  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  56.79 
 
 		 158 aa  92.8  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  41.67 
 
 		 190 aa  92  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  47.31 
 
 		 166 aa  92  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  26.74 
 
 		 9030 aa  90.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  33.57 
 
 		 219 aa  90.9  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  35.42 
 
 		 369 aa  90.5  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  49.47 
 
 		 193 aa  90.5  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  27.29 
 
 		 8682 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  41.88 
 
 		 288 aa  88.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  55.71 
 
 		 95 aa  88.6  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  41.96 
 
 		 236 aa  87.4  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>