104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  100 
 
 
414 aa  837    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  41.03 
 
 
809 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  37.5 
 
 
2670 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.39 
 
 
1227 aa  140  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  31.56 
 
 
2415 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  30.25 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  29.66 
 
 
907 aa  122  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  34.98 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  26.49 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  28.57 
 
 
741 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  34.04 
 
 
3060 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  32.08 
 
 
1038 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  27.13 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  28.87 
 
 
857 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  25.7 
 
 
467 aa  108  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  30.71 
 
 
427 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  27.62 
 
 
898 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  32.93 
 
 
323 aa  102  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  27.05 
 
 
862 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  29.01 
 
 
377 aa  101  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  27.63 
 
 
862 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  30.4 
 
 
934 aa  99.8  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  26.4 
 
 
647 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  26.09 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  28.18 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  28.1 
 
 
253 aa  96.7  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  31.49 
 
 
754 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  27.47 
 
 
300 aa  94  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  32.42 
 
 
250 aa  93.6  5e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  32.17 
 
 
774 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  31.35 
 
 
251 aa  85.9  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  37.17 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  32.78 
 
 
250 aa  84  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  28.4 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  26.39 
 
 
609 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  32.72 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  32.04 
 
 
200 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  27.59 
 
 
634 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  26.88 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  30.92 
 
 
800 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  26.05 
 
 
848 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  38.33 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  29.02 
 
 
933 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  27.16 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  26.59 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  28.07 
 
 
558 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  28.03 
 
 
762 aa  74.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  26.8 
 
 
789 aa  73.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  26.14 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  31.53 
 
 
982 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  39.6 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  32.26 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  28.49 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  30 
 
 
180 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  34.51 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  21.95 
 
 
710 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  22.71 
 
 
1575 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.33 
 
 
355 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  28.25 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  34.17 
 
 
190 aa  63.9  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  24.3 
 
 
1518 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  28.25 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  29.2 
 
 
1732 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  33.96 
 
 
913 aa  60.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  27.27 
 
 
446 aa  60.5  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  36.75 
 
 
658 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  24.6 
 
 
450 aa  59.7  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  27.01 
 
 
226 aa  59.7  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  28.83 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  33.01 
 
 
228 aa  58.5  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  37.36 
 
 
2833 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  26.32 
 
 
1214 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0135  hypothetical protein  34.45 
 
 
324 aa  58.2  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2931  hypothetical protein  29.94 
 
 
619 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1243  hypothetical protein  29.94 
 
 
603 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  24.73 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  29.87 
 
 
321 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  29.77 
 
 
182 aa  56.6  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  41.79 
 
 
413 aa  56.6  0.0000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  26.15 
 
 
460 aa  56.6  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  35.11 
 
 
560 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  38.89 
 
 
181 aa  54.3  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  26.8 
 
 
1882 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  27.07 
 
 
288 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  31.68 
 
 
173 aa  52.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  33.33 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  32.08 
 
 
257 aa  50.4  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0735  hypothetical protein  33.33 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  28.32 
 
 
987 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0242  putative lipoprotein  28.47 
 
 
762 aa  48.9  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0120138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  26.36 
 
 
361 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  40.98 
 
 
95 aa  46.6  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  30.93 
 
 
166 aa  46.6  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1014  hypothetical protein  25.81 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  36 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  31.73 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  21.99 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  45.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  21.46 
 
 
1052 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  32.22 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>