43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1450 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 848 aa  1706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.79 
 
 		 710 aa  293  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1243  hypothetical protein  39.32 
 
 		 603 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2931  hypothetical protein  39.81 
 
 		 619 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  42.13 
 
 		 224 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  37.69 
 
 		 198 aa  128  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  36.68 
 
 		 200 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  36.68 
 
 		 200 aa  122  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.47 
 
 		 1882 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  33.5 
 
 		 197 aa  104  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  34.72 
 
 		 215 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  24.39 
 
 		 1518 aa  99.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.68 
 
 		 1732 aa  94  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.18 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  32.8 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.89 
 
 		 1842 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  26.05 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  32.02 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  28.87 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  25 
 
 		 460 aa  70.5  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  32.97 
 
 		 987 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  21.55 
 
 		 1227 aa  65.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  27.89 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  30.17 
 
 		 180 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  28.02 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  29.08 
 
 		 199 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  32.88 
 
 		 189 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1052 aa  58.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1014  hypothetical protein  27.67 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  27.43 
 
 		 2392 aa  57.4  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  27.11 
 
 		 395 aa  55.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  29.95 
 
 		 201 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  28.44 
 
 		 320 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1247 aa  50.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  24.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  24.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  24.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  26.62 
 
 		 189 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  29.73 
 
 		 115 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  24.75 
 
 		 196 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 		 194 aa  46.6  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  27.14 
 
 		 193 aa  44.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>