25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2493 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  78.24 
 
 		 193 aa  322  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  56.19 
 
 		 196 aa  228  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  58.76 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  58.76 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  58.76 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  35.35 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  33.17 
 
 		 224 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  32.14 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  34.2 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  33.33 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  32 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  34.03 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  34.64 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  26.15 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  26.87 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  35.14 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  25.95 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  25.95 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  28.42 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  26.84 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  27.43 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  25.64 
 
 		 848 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>