18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1475 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  100 
 
 		 200 aa  244  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  99.13 
 
 		 200 aa  243  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  100 
 
 		 115 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  85.59 
 
 		 198 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  56.76 
 
 		 224 aa  150  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  45.87 
 
 		 215 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  37.27 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  35.42 
 
 		 189 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  30.91 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  31.3 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  22.52 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  27.03 
 
 		 189 aa  48.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  29.73 
 
 		 848 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  28.16 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  28.16 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  28.16 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>