17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4481 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  32.37 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  32.43 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  31.67 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  32.21 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  28.9 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  29.95 
 
 
848 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  31.03 
 
 
320 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  29.82 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  22.95 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  26.04 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  27.54 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  23.24 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  23.24 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  24.1 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  26.63 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>