24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0750 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  40.64 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  42.45 
 
 
215 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  34.59 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  33.16 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  33.81 
 
 
198 aa  94.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  34.53 
 
 
200 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  34.53 
 
 
200 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  30.41 
 
 
196 aa  88.2  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  35.42 
 
 
115 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  33.16 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  33.33 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  29.51 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  29.51 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  29.51 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  31.66 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  29.57 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  31.07 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  32.24 
 
 
848 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  30.66 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  24.7 
 
 
320 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  30.19 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>