26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3046 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  58.38 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  46.5 
 
 
224 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  48.44 
 
 
198 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  47.4 
 
 
200 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  47.4 
 
 
200 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  42.45 
 
 
189 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  34.55 
 
 
196 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  34.72 
 
 
848 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  45.87 
 
 
115 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  29.8 
 
 
193 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0603569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  32 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  30.93 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  32.16 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  30.37 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  30.37 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  30.37 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  32.62 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  26.67 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  32 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  32.43 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  29.78 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  29.78 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  30.17 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  41.86 
 
 
320 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  25.79 
 
 
180 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>