26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3859 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  31.12 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  32.81 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  37.13 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  36.75 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  32.8 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  32.66 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  26.42 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  26.04 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  26.04 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  26.67 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  33.12 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  34.64 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  32.02 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  28.65 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  35.06 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  35.06 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  35.06 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  30.56 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  22.52 
 
 		 115 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  26.57 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  27.54 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>