17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0740 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  407  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  407  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  67.71 
 
 		 194 aa  274  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  27.75 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  24.72 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  24.87 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  32 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  29.78 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  26.02 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  27.84 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  27.84 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  27.32 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  26.67 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  26.63 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  27.72 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  23.33 
 
 		 848 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>