26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3732 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  38.38 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0603569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  35.35 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  35.2 
 
 
200 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  35.2 
 
 
200 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  32.31 
 
 
197 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  32.65 
 
 
198 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  34.36 
 
 
199 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  34.39 
 
 
196 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  37.44 
 
 
199 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  32.16 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  33.16 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  33.16 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  33.16 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  36.75 
 
 
214 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  32.8 
 
 
848 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  30.1 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  32.37 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  34.06 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  26.02 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  26.02 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  29.59 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  31.3 
 
 
115 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  30.15 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  31.09 
 
 
320 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>