26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3112 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  82.14 
 
 		 200 aa  345  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  82.14 
 
 		 200 aa  345  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  60.41 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  85.59 
 
 		 115 aa  207  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  48.44 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  43.39 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  37.69 
 
 		 848 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  32.65 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  34.2 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  31.41 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  33.81 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  30.73 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  26.42 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  31.09 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  29.84 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  29.84 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  29.84 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  26.84 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  27.89 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  27.72 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  27.32 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  27.32 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  29.17 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  30.39 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  22.95 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>