26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1869 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  58.38 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  43.39 
 
 
198 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  41.45 
 
 
224 aa  158  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  41.88 
 
 
200 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  41.88 
 
 
200 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  42.86 
 
 
189 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  37.43 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  32.31 
 
 
198 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  30.77 
 
 
193 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  33.5 
 
 
848 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 
194 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  36.6 
 
 
199 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  28.57 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  31.91 
 
 
180 aa  89  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  32.8 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  37.27 
 
 
115 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  32.89 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  30.21 
 
 
320 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  29.1 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  29.1 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  29.1 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  24.72 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  24.72 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  31.67 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  27.32 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>