23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4482 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  100 
 
 
195 aa  406  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  100 
 
 
195 aa  406  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  100 
 
 
195 aa  406  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  69.59 
 
 
196 aa  300  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  58.76 
 
 
194 aa  231  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  59.26 
 
 
193 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  33.16 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  30.89 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  30.37 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  30.37 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  29.84 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  29.84 
 
 
224 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  29.1 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  33.1 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  35.06 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  28.98 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  27.13 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  27.23 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  23.4 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  24.74 
 
 
848 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  29.09 
 
 
115 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  25.13 
 
 
189 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  25 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>