23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4586 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  71.86 
 
 		 199 aa  287  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  37.43 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  34.36 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  32.81 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  30.89 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  32.46 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  32.46 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  26.84 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  28.29 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  28.87 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  30.69 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  26.73 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  27.66 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  27.66 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  27.66 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  39.37 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  26.04 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  27.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  27.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  26.04 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>