21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2703 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  67.71 
 
 		 195 aa  274  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  67.71 
 
 		 195 aa  274  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  29.47 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  30.1 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  29.44 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  31.43 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  27.32 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  28.98 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  28.98 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  28.98 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  32.5 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  32.5 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  29.17 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  25.37 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  26.14 
 
 		 848 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  34.72 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  25.64 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>