25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1163 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  71.86 
 
 		 199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  36.6 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  38.78 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  32.66 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  32.62 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  31.09 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  29.23 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  29.23 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  27.89 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  28.71 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  34.97 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  29.59 
 
 		 848 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  27.23 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  27.23 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  27.23 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  26.63 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  27.51 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  27.62 
 
 		 320 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  28.4 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  32.58 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  28.26 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  28.26 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  23.44 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>