21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1043 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  31.91 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  29.47 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  27.75 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  27.75 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  30.93 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  28.95 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  28.87 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  28.87 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  30.17 
 
 		 848 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  28.65 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  30.81 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  25.39 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  28.96 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1010  tail protein  25.79 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2247  tail protein  22.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4482  tail protein  22.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2250  tail protein  22.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  0.0185338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  30.66 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  23.91 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>