18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0184 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0184  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  40.64 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  32.89 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  32 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  30.95 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  27.72 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  28 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2493  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  30.15 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  27.51 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  26.04 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  27.03 
 
 		 115 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  29.82 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  26.62 
 
 		 848 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  25.4 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  26.57 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2703  hypothetical protein  25.64 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>