19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2443 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2443  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1869  hypothetical protein  31.36 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  hitchhiker  0.000000000000333722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3046  hypothetical protein  43.85 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142317  hitchhiker  0.0000191846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4586  tail protein, putative  39.37 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2732  hypothetical protein  29.82 
 
 		 200 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2810  putative bacteriophage protein GP48  29.82 
 
 		 200 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2083  hypothetical protein  27.43 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3112  hypothetical protein  30.39 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4481  tail protein, putative  31.03 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3859  hypothetical protein  35.29 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  28.76 
 
 		 848 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3732  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1163  tail protein, putative  27.78 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0750  hypothetical protein  25.15 
 
 		 189 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2583  hypothetical protein  24.17 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0697  hypothetical protein  25.83 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0740  hypothetical protein  25.83 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1475  putative bacteriophage protein GP48  28.28 
 
 		 115 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.5374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1043  hypothetical protein  31.2 
 
 		 180 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>