41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0574 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  33.94 
 
 		 1518 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  39.83 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.54 
 
 		 1882 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.36 
 
 		 460 aa  95.9  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  33.87 
 
 		 1052 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  31.91 
 
 		 1842 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  29.28 
 
 		 395 aa  86.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1247 aa  85.5  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  27.94 
 
 		 1732 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  30.28 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.35 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  28.99 
 
 		 2495 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  27.24 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  33.79 
 
 		 2392 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  38.68 
 
 		 730 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  29.81 
 
 		 476 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1055 aa  66.6  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  30.51 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  28.02 
 
 		 848 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  35.24 
 
 		 691 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  37.89 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  29.32 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.09 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  27.64 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1118 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  32.86 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  30.19 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  30.49 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  38.54 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  34.38 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  40 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  31 
 
 		 506 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  30.26 
 
 		 538 aa  45.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  34.17 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  27.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  31.75 
 
 		 158 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  32.97 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>