44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0234 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  70.28 
 
 		 589 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  58.65 
 
 		 352 aa  151  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  47.19 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  55.4 
 
 		 456 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  61.11 
 
 		 269 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  44.31 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  47.3 
 
 		 399 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  43.02 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  45.32 
 
 		 395 aa  102  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  43.5 
 
 		 1842 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  45.45 
 
 		 2495 aa  99  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40.43 
 
 		 1882 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1055 aa  79  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  37.19 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  36.21 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  41.35 
 
 		 1052 aa  72  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  32.91 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  29.85 
 
 		 2392 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  32.76 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  32.56 
 
 		 730 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  31.34 
 
 		 538 aa  68.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  29.41 
 
 		 1732 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  35.57 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  36.36 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  49.28 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  32.16 
 
 		 1017 aa  58.9  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  32.12 
 
 		 1518 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  25.2 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  30.05 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  29.69 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  36.19 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.24 
 
 		 361 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  36.56 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  32.86 
 
 		 285 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  40.79 
 
 		 657 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1247 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  32.93 
 
 		 271 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  34.68 
 
 		 434 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  26.87 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  31.82 
 
 		 691 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1118 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  31.11 
 
 		 506 aa  41.2  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>