24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1632 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  34.51 
 
 
355 aa  71.6  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  28.88 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  30.64 
 
 
1882 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  30.46 
 
 
361 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  32.14 
 
 
2392 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  31.39 
 
 
1052 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  35.53 
 
 
1247 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.31 
 
 
1842 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  31.69 
 
 
1732 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  27.65 
 
 
352 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  32.6 
 
 
460 aa  58.9  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28 
 
 
1518 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.4 
 
 
476 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.92 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  25.73 
 
 
458 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  26.76 
 
 
2031 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  27.27 
 
 
278 aa  52.4  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  37.84 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  27.03 
 
 
730 aa  45.1  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  23.31 
 
 
382 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1992  hypothetical protein  36.73 
 
 
111 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  26.87 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  37.66 
 
 
285 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>