43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2534 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  655    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  36.98 
 
 
1882 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.52 
 
 
1842 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  31.28 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.36 
 
 
1052 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  30.2 
 
 
476 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  32 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  34.62 
 
 
361 aa  89.7  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  30.81 
 
 
1732 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  28.22 
 
 
460 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  28.77 
 
 
730 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  32.74 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  29.24 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  29.41 
 
 
1518 aa  79.3  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  27.31 
 
 
2392 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  32.09 
 
 
1247 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  35.92 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
589 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  26.55 
 
 
458 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  32.76 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  27.04 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  28.24 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  32.59 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  28.09 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  26.52 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  23.59 
 
 
2495 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  28.92 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  30.59 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  28.57 
 
 
691 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  28.03 
 
 
231 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  25.6 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  25.61 
 
 
434 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  28.96 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  26.32 
 
 
158 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  23.49 
 
 
523 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  27.22 
 
 
460 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  26.21 
 
 
657 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  23.17 
 
 
271 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  26.45 
 
 
2031 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>