46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0235 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  83.27 
 
 		 589 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  61.11 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  59.43 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  55.66 
 
 		 456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  53.4 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  40.34 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  46.36 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  49.5 
 
 		 399 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  42.06 
 
 		 2495 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.35 
 
 		 1842 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  36.09 
 
 		 395 aa  79  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1052 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  30.82 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  33.94 
 
 		 1732 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  33.9 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  43.88 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  37.27 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1055 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  30.87 
 
 		 730 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  34.06 
 
 		 1882 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  30.91 
 
 		 2392 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  40.91 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  43.94 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  37.21 
 
 		 1017 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  32.97 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  32.69 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  38.54 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1331 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  35.58 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  37.84 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0698  phage prohead protease, HK97 family  29.92 
 
 		 734 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  34.21 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  30 
 
 		 1323 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1247 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  27.47 
 
 		 538 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 499 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  31.88 
 
 		 691 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 465 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 870 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1118 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  34.62 
 
 		 657 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 465 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  61.76 
 
 		 109 aa  42.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1297 aa  42.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>