30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16110 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  771    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1052 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.62 
 
 		 1882 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.49 
 
 		 1732 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  22.22 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  32.58 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  32.58 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  34.69 
 
 		 691 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  32.71 
 
 		 657 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  28.16 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  24.02 
 
 		 458 aa  52.8  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  26.84 
 
 		 2495 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  25.97 
 
 		 2392 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1055 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1247 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  32.97 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  33.33 
 
 		 1518 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 589 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  35.59 
 
 		 158 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  25.57 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  24.46 
 
 		 1842 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  36 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  27.32 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  30.99 
 
 		 730 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  27.27 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  35 
 
 		 476 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  33.75 
 
 		 231 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  32.22 
 
 		 506 aa  42.7  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>